阿克塞县矿产资源丰富，是资源相对富集的地区，工业在经济中占有较大份额。改革开放以来，阿克塞县不断调整产业结构、经济结构不断优化，特别是"十一五"末提出了主攻资源综合利用、现代农牧业和民族旅游业三大产业，加快培育五大产业集群的发展战略，经济结构调整实现了新的突破。三次产业结构由1964年的32.5:6.5:61调整为2013年的3.7:65.3:31,三次产业内部结构也逐步趋向优化。

2013年，阿克塞县生产总值达到130847万元，比1978年的349万元增长了374倍，人均GDP由1978年的496元增加到2013年的146574元，增长了295倍;财政收入达到17907万元，比1978年的268万元增长了66倍;农牧民人均纯收入由1978年的279元增加到2013年的17340元，增长了62倍;城镇居民人均可支配收入由1978年的717元增加到2013年的22859元，增长了31倍。

阿克塞哈萨克族自治县是一个传统的纯牧业县，畜牧业是自治县的基础产业，也是农牧民增收致富的支柱产业，农牧民人均纯收人的82%来自于畜牧业。

1954年建县以来，农牧业经济发展过程中克服了各种困难，通过整合优化产业布局，畜牧业开始由自给自足的小农经济向商品经济转型，由数量型向质量型转型，由靠天养畜向科学养畜转变，农业经济结构、经济总量实现了巨大的飞跃。

从建县初期到1978年，阿克塞县农牧业生产关系和管理制度出现了新的变革，实现了农业从无到有、畜牧业稳定发展的过程。农牧业总产值由1978年的200万元增长到2013年的7327万元，增长了35.64倍;农牧业增加值由1978年的179万元增长到2013年的4792万元，增长了25.77倍。21世纪初，农牧业以提高效益、促进农牧民增收为目标，通过打造升级支柱产业、重点建设特色产业和精心培育富民产业等战略措施，强力推进农牧业全面协调发展。

随着市场经济体制的不断完善，阿克塞县以市场为导向，积极引导农牧民调整产业结构，以传统畜牧业发展为抓手，逐步转变成为农、畜并重的现代化农业生产格局，形成了粮、经、草三元种植结构。从2010年起至2014年，先后累计投人4157.86万元，建设红柳湾现代农业科技示范园，建成高标准戈壁石砌墙设施温室126座，通过推行有机生态无土栽培技术，配套建成蔬菜保鲜库、贮藏地窖、多功能管理房、交易市场以及膜下滴灌、自动卷帘机等基础设施，将农业生产由单一的以农补牧、以牧促农，逐步向高效、特色现代农业转变，彻底改变了本地长期以来蔬菜靠外调用的历史，填补了农业生产空白。截至2013年底，农作物播种面积达8299亩，粮经草比例调整为16:28:56，种植业由粮食型转为经济型。

自2007年起至2014年，累计投资1256.5万元，共建成设施养殖小区2处、种畜扩繁场1个，修建高标准棚舍72座，发展设施养殖户82户，农牧业生产综合效益明显提高，社会主义新农村、新牧区建设步伐逐步加快。

2008年，自治县被确定为新农村、新牧区建设试点，按照"一心两点"模式，即两个村建立1个中心社区聚集点、2个一般集聚点，分阶段改撤16个自然村落，将分散居住的农牧民逐步集聚到农牧村社区中，让草场集约化经营，村庄成块、农田成片。

21世纪以来，阿克塞县先后培育发展了霍尔勒斯养殖专业合作社、合众佳克斯农机农民合作社和达木蔬菜农民专业合作社等9个合作组织，"公司+农户"的生产经营格局已初步形成，农牧业规模化龙头企业初步显现。通过实施农牧业机械化推广普及、牲畜改良社会化服务等，积极推动畜牧业规模化经营、集约化发展，为农牧业增效、农牧民增收奠定了基础。

21世纪以来，阿克塞县畜牧业实现了单纯数量型发展到数量质量并举的转变，通过引进牛羊等优良品种，饲养方式也由传统粗放的散养方式向设施精养的方向转变。自2000年阿克塞县种畜繁育中心成立以来，先后引进新西兰波德代、无角陶赛特、新疆哈萨克大尾羊、辽宁盖县绒山羊等优质畜种7130只，发展了生态型地方畜种，2014年，良种羊覆盖率达91%以上。