截至2011年，肃州区辖6个街道(东北街街道、东南街街道、工业园街道、新城街道、西北街街道、西南街街道)、7个镇(总寨镇、银达镇、西洞镇、上坝镇、三墩镇、清水镇、金佛寺镇)，9个乡(下河清乡、西峰乡、黄泥堡裕固族乡、铧尖乡、果园乡、丰乐乡、东洞乡、泉湖乡)，共154个社区。

肃州区位于甘肃省西北部，酒泉市东部，祁连山北麓、河西走廊中西部，地理坐标为东经98°20′-99°18′，北纬39°10′-39°59′，东与高台县及肃南县接壤，南倚祁连山与肃南县交界，西与嘉峪关市毗邻，北抵金塔夹山与金塔县相连。东西长104公里，南北宽84公里，总面积3353.74平方公里。

肃州区地处蒙新荒漠地带，地理纬度和海拔比较高，属河西走廊平原"扇顶-扇裙-扇缘"三阶地带，境内无山，平坦开阔，地势西南部高而东北部低，略呈倾斜，平均海拨1360米。

肃州区属典型的大陆性气候，气候的整体特征为:气候干燥、降水少、蒸发强烈日照长、冬冷夏热温差大、秋凉春旱多风沙。

肃州区年平均气温7.3℃，七月份最高平均为21.8℃，元月份最低平均气温为-9.7℃，低于零度的时间为128天。

肃州区降水量少，季节分配不均，夏季雨量集中，降水为48.4mm，占全年降水量的56.7%;冬季雨雪稀少，降水为5.3mm，占全年降水量的6.2%。降水由北向南随地势的增高而增大，境内海拔每升高100m，降水增加5.09mm，年平均降水量87.7mm。年平均蒸发量为2148.8mm，年平均相对湿度为46%。

肃州区日照长，年平均日照时数为3033.4h，比同纬度的北京多246.5h，平均每天可照射时数8.3h，年日照百分率为68%。太阳辐射强度大，年总量为145.6千卡/平方厘米，与同纬度的北京相比多11.4千卡/平方厘米，月总量为16.0千卡/平方厘米。

肃州区无霜期短，早霜初日平均为9月24日，最早9月18日，最晚10月16日，相差28天;晚霜终日平均为主5月16日，最早4月14日，最晚5月22日，相差38天，无霜期平均130天，最长151天，最短105天。

肃州区多大风和干热风。风向为西北季风，全年平均风速2.4m/s，8级大风平均17.1天，最多达40天，3、4、5月平均8.9天，最多达25天，6、7月多干热风。

肃州区境内有讨赖河、洪水河、红山河、观山河、丰乐河等六条内陆河流，属于黑河水系的支流，均发源于祁连山。

截至2010年，肃州区已探明和发现的主要矿产资源有石灰岩、白云岩、天青石、泥炭、硝盐、煤、花岗岩、建筑用砂石、砖瓦用粘土及石油、天然气等10多个矿种。已开发利用的矿种有建筑用砂石、粘土、石灰岩、白云岩、花岗岩、粉细砂、铸型用粘土等7种矿产，年开采量:建筑用砂石约318.8万立方米，石灰岩、花岗岩等4.2万吨，制砖粘土约60万立方米，烧结红砖24000万块。

肃州区境内地表多年平均径流量为6.98亿立方米，全年地下水补给量8.52亿立方米，总排泄量为8.5亿立方米。

截至2011年，肃州区总人口40.64万人(公安年报数，不含流动暂住人口6.95万人)。常住人口43.08万人。人口出生率0.723%，死亡率0.362%，自然增长率0.361%。有汉族、回族、裕固族等15个民族。

2011年，肃州区拥有客运车辆1237 辆，其中班线客车254 辆;城市公交车183 辆，其中无人售票车120辆。全区完成公路客运量4922万人次，较2010年增长29.87%;客运周转量122594万人公里，较2010年增长28.11%;公路货运量1578万吨，较2010年增长16.89%;货运周转量206636万吨公里，较2010年增长21.27%。