早在四千年前，安西就有先民繁衍生息。

秦以前为羌戎所据，秦时为大月氏占有，汉武帝"列四郡据两关"时，为敦煌郡所辖，两晋沿袭汉制，隋置常乐郡。

唐武德五年(公元622年)改称瓜州。

宋元相沿，至清雍正年间设安西卫。

民国二年(公元1913年)改为安西县。此县名一直延用至2006年初。

安西县于1949年9月28日解放，由中国人民解放军西北野战军三军八师接管，10月7日安西县人民政府成立，隶属酒泉专区行政公署。安西县，县名一直延用至2006年初。

2006年经国务院批准更名为瓜州县。

瓜州县下辖5镇10乡86个行政村。

五镇:渊泉镇、柳园镇、三道沟镇、南岔镇、锁阳城镇;

十乡:瓜州乡、西湖乡、腰站子乡、河东乡、布隆吉乡、双塔乡、梁湖乡、沙河乡、广至乡、七墩乡。

瓜州县地处甘肃省河西走廊西端，东连玉门市，西接敦煌市，南北与肃北蒙古族自治县毗邻，西北与新疆哈密市相接，自古以来就是东进西出的交通枢纽，古丝绸之路的商贾重镇。县境东西长185公里，南北宽220公里。地处东经94度45分--97度00分，北纬39度52分--41度53分。东西宽185公里，南北长期20公里，总面积24130平方公里。

瓜州县地处安敦盆地内，地形南北高，逐渐向盆地中央疏勒河谷地倾斜。北部最高处的芨芨台子山，海拔2452米;南部为祁连山北麓山前地带，最高处的朱家大山，海拔3547米;中部走廊地带被北东向的截山子分为两部分;南端为踏实盆地，海拔1259~1750米;北部为疏勒河中下游干三角洲，地势平坦开阔，由东北向西南微倾斜，海拔1060~1300米，县城所在地渊泉镇，海拔1177.8米。

瓜州县有山区、戈壁、走廊冲洪积平原三种基本地貌形态。

北部山区戈壁倾斜平原区，为一系列平行断续的中低山残丘，山体多呈东西走向，海拔2000米左右，相对高差30~300米。山前多形成山麓剥蚀面，山顶多成浑圆状。山前外围为广阔的洪积倾斜平原，海拔1150~1600米，地势平坦，倾斜平原覆盖着中上更新世洪积、坡积沙砾碎石，植被稀少。